Die Schulverwaltung sorgt als Dienstleistungszentrum der Schule Bäretswil für einen verwaltungstechnisch und organisatorisch professionell geleiteten Schulbetrieb. Dazu gehören auch die gesamte Schüleradministration, die Schulgesundheit, alle sonderpädagogischen Massnahmen, die Tagesstrukturen, die Schülertransporte und noch weitere administrative Aufgaben. In all diesen Bereichen arbeitet die Schulverwaltung eng mit den Schulleitungen, den Schulpflegemitgliedern, den Erziehungsverantwortlichen, dem Volksschulamt und diversen Fachstellen zusammen.